印度谷螟转录组测序及功能注释分析

• 作者: 于英威 彭峻 李慧 涂斌 王殿轩
• 来源期刊: 河南工业大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 印度谷螟 转录组 基因注释 编码序列 SSR分子标记
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 粮食储藏研究
• 页码范围: 95-101,113
• 页数: 8页
• 分类号: Q522.2
• 字数: 4718字
• 语种: 中文

摘要

印度谷螟Plodia interpunctella(Hübener)是我国危害较严重的仓储害虫,食性广,发生普遍.为有效开发印度谷螟基因资源,采用Illumina Hi Seq 2500平台对印度谷螟进行转录组测序,同时对原始数据进行过滤、组装及生物信息学分析.经序列拼接后获得116 399条Unigenes,平均长度为1 079 bp.利用7大公共数据库比对后,成功注释63 679条Unigenes,其中有45 225条Unigenes与GO数据库中基因具有相似性,按功能可将其分成细胞组分、分子功能和生物过程3大类,55亚类;有24 658条Unigenes被注释到KOG数据库,根据功能将其分为26类;有34 202条Unigenes被注释到KEGG代谢通路中,分属于5类代谢通路;经SSR分析后获得31 301个SSR标记.本研究成功获得了印度谷螟转录组数据,为进一步研究印度谷螟的基因功能,分析挖掘其关键基因,功能验证及分子标记开发等研究提供了丰富的基础数据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李慧		3	1	1.0	1.0
2	于英威		5	6	2.0	2.0
3	涂斌		1	1	1.0	1.0
4	彭峻		1	1	1.0	1.0