高粱TCP基因家族全基因组鉴定及表达分析

• 作者: 李会云 白雪婷 郑玲
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 高粱 TCP基因 全基因组鉴定 表达分析 ABA处理 PEG处理
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 作物栽培·遗传育种
• 页码范围: 30-36
• 页数: 7页
• 分类号: S514
• 字数: 4424字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2019.10.005

摘要

为了研究高粱TCP( Teosinte branched 1/cycloidea/proliferating cell factors)基因家族在生长发育和逆境胁迫中的作用,利用生物信息学方法对高粱TCP基因家族成员进行鉴定,并对其进行染色体定位、保守结构域、进化树和表达模式分析.结果表明,共鉴定出27个高粱TCP基因,其在9条染色体上呈不均匀分布,并在3、6、9 号等染色体上存在明显的基因簇.进化树分析显示,高粱TCP蛋白可被分为ClassⅠ和ClassⅡ 2 大类,而ClassⅡ类又可分为CYC/TB1 和CIN 2 个亚类, ClassⅠ包含10个TCP蛋白, CYC/TB1包含3个TCP蛋白,CIN包含14个TCP蛋白. 27个高粱TCP蛋白均有非典型的bHLH( Basic-helix-loop-helix)保守区,其中2个有R结构域.表达模式分析表明,大部分高粱TCP基因在种子、胚、雌蕊、早期花序中表达;PEG处理下,高粱根中大部分TCP基因表达量升高,ABA处理嫩枝中个别基因表达量升高,推测上调表达的高粱TCP基因可能在干旱胁迫响应过程中起重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑玲	洛阳师范学院生命科学学院	31	88	5.0	8.0
2	李会云	洛阳师范学院生命科学学院	7	2	1.0	1.0
3	白雪婷	洛阳师范学院生命科学学院	1	0	0.0	0.0