结核分枝杆菌Wag31蛋白的生物信息学分析

• 作者: 付玉荣 伊正君 刘相群
• 来源期刊: 中国病原生物学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 结核分枝杆菌 Wag31蛋白 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 995-1000
• 页数: 6页
• 分类号: R378.911
• 语种: 中文
• DOI: 10.13350/j.cjpb.190902

摘要

目的 运用生物信息学方法预测分析结核分枝杆菌Rv2145c基因编码蛋白Wag31的结构与功能. 方法 由NCBI数据库中获得Rv2145c基因及蛋白Wag31的编码序列,运用ProtParam及ProtScale对Wag31蛋白的基本理化特性及亲疏水性进行预测分析;运用NetPhos、TMHMM及SignalP 4.1分析Wag31的磷酸化位点、跨膜区结构及信号肽;分别运用SOPMA、SWISS-MODEL、ABCpred以及SYFPEITHI等工具预测Wag31蛋白的二级、三级结构以及抗原表位;运用STRING预测Wag31蛋白的相互作用蛋白,并进行富集分析. 结果 细胞壁合成蛋白Wag31由260个氨基酸组成,分子式为C1200 H1946 N370O410S5,相对分子质量28.277 18×10 3,属于不稳定蛋白,具有亲水性;蛋白质二级结构分析显示,无规则卷曲(Cc)占24.23％,α-螺旋(Hh)、β-折叠(Ee)和β-转角(Tt)含量分别占73.08％、1.54％和1.15％.Wag31蛋白无信号肽和跨膜区结构,具有20个磷酸化优势位点,预测该蛋白含有25个B细胞抗原优势表位以及11个CTL细胞抗原优势表位;Wag31蛋白与GarA、PknA、PknB、FtsZ等蛋白相互作用,并参与多种生物过程. 结论 生物信息学分析Wag31蛋白具有潜在的B、T细胞抗原表位,能够磷酸化并与多种蛋白相互作用,可为研发结核病疫苗的候选蛋白.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	付玉荣		136	281	8.0	9.0
2	伊正君		135	257	8.0	8.0
3	刘相群		2	0	0.0	0.0