基于核酸物化属性显著性约简的m6 A位点识别

• 作者: 张明 徐妍 於东军 王长宝 陈韬
• 来源期刊: 南京理工大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 启发式约简算法 分类器融合 伪二核苷酸成分 自协方差与互协方差
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 页码范围: 199-208
• 页数: 10页
• 分类号: TP18
• 字数: 8587字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14177/j.cnki.32-1397n.2019.43.02.012

摘要

为了提高核糖核酸( RNA)序列上6-甲基腺嘌呤( m6A)位点的预测精度,该文提出一种新的基于核酸物化属性显著性度量的K重选择启发式约简算法.通过该算法获得K个物化属性约简子集来重新编码RNA样本,并结合支持向量机( SVM)训练得到K个基分类器,再通过分类器融合方法构建了m6A位点预测器.最后,在相同的基准数据上,采用留一法交叉验证分别验证了伪二核苷酸成分分析和自协方差与互协方差变换两种典型的基于核酸物化属性的特征表示算法.实验结果表明,该文算法可显著提高m6A位点预测的总体性能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	於东军	南京理工大学计算机科学与工程学院	64	503	15.0	19.0
2	张明	江苏科技大学计算机学院	38	289	9.0	16.0
6	王长宝	江苏科技大学计算机学院	12	18	3.0	3.0
7	陈韬	江苏科技大学计算机学院	2	2	1.0	1.0
8	徐妍	江苏科技大学计算机学院	1	1	1.0	1.0