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基于生物信息学分析探究银屑病关键基因和通路
基于生物信息学分析探究银屑病关键基因和通路
作者:
刘萌
张梦迪
段琪琪
王敏
肖生祥
郑焱
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
银屑病
生物信息学
差异基因
富集分析
发病机制
摘要:
目的 通过生物信息学方法,寻找在银屑病中差异表达的基因,明确其功能,探讨银屑病的发病机制.方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中下载GSE6710数据集,以P<0.05及表达变化大于1.5倍筛选差异基因.结果 共筛选出275个差异基因,其中160个上调基因,115个下调基因.对差异基因进行GO和KEGG富集分析,GO分析显示上调基因主要富集的生物过程为免疫应答、趋化作用、有丝分裂和炎症反应;下调基因主要富集的生物过程为糖代谢过程、药物反应、分泌调节和急性炎症反应.KEGG分析显示差异基因主要富集的信号通路包括:趋化因子信号通路、细胞因子-细胞因子受体信号通路、RIG-I样受体信号通路、PPAR信号通路.PPI网络分析得到的10个枢纽基因为:IL--8、CCNB1、CDC20、IFIT1、GBP1、DDX58、ISG15、MX1、OAS2、IRF7.结论 IL-8、CCNB1、CDC20、IFIT1等基因可能参与银屑病的发病机制.
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文献信息
篇名
基于生物信息学分析探究银屑病关键基因和通路
来源期刊
中国皮肤性病学杂志
学科
医学
关键词
银屑病
生物信息学
差异基因
富集分析
发病机制
年,卷(期)
2019,(11)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
1232-1238
页数
7页
分类号
R758.63
字数
语种
中文
DOI
10.13735/j.cjdv.1001-7089.201903031
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
肖生祥
西安交通大学第二附属医院
147
488
12.0
16.0
2
王敏
西安交通大学第二附属医院
108
817
14.0
26.0
3
郑焱
西安交通大学第二附属医院
76
152
6.0
8.0
4
段琪琪
西安交通大学第二附属医院
2
0
0.0
0.0
5
刘萌
西安交通大学第二附属医院
5
1
1.0
1.0
6
张梦迪
西安交通大学第二附属医院
3
0
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二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
银屑病
生物信息学
差异基因
富集分析
发病机制
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国皮肤性病学杂志
主办单位:
西安交通大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-7089
CN:
61-1197/R
开本:
大16开
出版地:
陕西省西安市西五路157号
邮发代号:
52-17
创刊时间:
1987
语种:
chi
出版文献量(篇)
9358
总下载数(次)
21
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