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摘要:
目的 通过生物信息学方法,寻找在银屑病中差异表达的基因,明确其功能,探讨银屑病的发病机制.方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中下载GSE6710数据集,以P<0.05及表达变化大于1.5倍筛选差异基因.结果 共筛选出275个差异基因,其中160个上调基因,115个下调基因.对差异基因进行GO和KEGG富集分析,GO分析显示上调基因主要富集的生物过程为免疫应答、趋化作用、有丝分裂和炎症反应;下调基因主要富集的生物过程为糖代谢过程、药物反应、分泌调节和急性炎症反应.KEGG分析显示差异基因主要富集的信号通路包括:趋化因子信号通路、细胞因子-细胞因子受体信号通路、RIG-I样受体信号通路、PPAR信号通路.PPI网络分析得到的10个枢纽基因为:IL--8、CCNB1、CDC20、IFIT1、GBP1、DDX58、ISG15、MX1、OAS2、IRF7.结论 IL-8、CCNB1、CDC20、IFIT1等基因可能参与银屑病的发病机制.
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文献信息
篇名 基于生物信息学分析探究银屑病关键基因和通路
来源期刊 中国皮肤性病学杂志 学科 医学
关键词 银屑病 生物信息学 差异基因 富集分析 发病机制
年,卷(期) 2019,(11) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 1232-1238
页数 7页 分类号 R758.63
字数 语种 中文
DOI 10.13735/j.cjdv.1001-7089.201903031
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 肖生祥 西安交通大学第二附属医院 147 488 12.0 16.0
2 王敏 西安交通大学第二附属医院 108 817 14.0 26.0
3 郑焱 西安交通大学第二附属医院 76 152 6.0 8.0
4 段琪琪 西安交通大学第二附属医院 2 0 0.0 0.0
5 刘萌 西安交通大学第二附属医院 5 1 1.0 1.0
6 张梦迪 西安交通大学第二附属医院 3 0 0.0 0.0
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发病机制
研究起点
研究来源
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期刊影响力
中国皮肤性病学杂志
月刊
1001-7089
61-1197/R
大16开
陕西省西安市西五路157号
52-17
1987
chi
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