基于生物信息学分析探究银屑病关键基因和通路

• 作者: 刘萌 张梦迪 段琪琪 王敏 肖生祥 郑焱
• 来源期刊: 中国皮肤性病学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 银屑病 生物信息学 差异基因 富集分析 发病机制
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1232-1238
• 页数: 7页
• 分类号: R758.63
• 语种: 中文
• DOI: 10.13735/j.cjdv.1001-7089.201903031

摘要

目的 通过生物信息学方法,寻找在银屑病中差异表达的基因,明确其功能,探讨银屑病的发病机制.方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中下载GSE6710数据集,以P＜0.05及表达变化大于1.5倍筛选差异基因.结果 共筛选出275个差异基因,其中160个上调基因,115个下调基因.对差异基因进行GO和KEGG富集分析,GO分析显示上调基因主要富集的生物过程为免疫应答、趋化作用、有丝分裂和炎症反应;下调基因主要富集的生物过程为糖代谢过程、药物反应、分泌调节和急性炎症反应.KEGG分析显示差异基因主要富集的信号通路包括:趋化因子信号通路、细胞因子-细胞因子受体信号通路、RIG-I样受体信号通路、PPAR信号通路.PPI网络分析得到的10个枢纽基因为:IL--8、CCNB1、CDC20、IFIT1、GBP1、DDX58、ISG15、MX1、OAS2、IRF7.结论 IL-8、CCNB1、CDC20、IFIT1等基因可能参与银屑病的发病机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖生祥	西安交通大学第二附属医院	147	488	12.0	16.0
2	王敏	西安交通大学第二附属医院	108	817	14.0	26.0
3	郑焱	西安交通大学第二附属医院	76	152	6.0	8.0
4	段琪琪	西安交通大学第二附属医院	2	0	0.0	0.0
5	刘萌	西安交通大学第二附属医院	5	1	1.0	1.0
6	张梦迪	西安交通大学第二附属医院	3	0	0.0	0.0