小黑杨基因组的初步组装及SSR信息分析

• 作者: 刘轶 周玉敏 李开隆 王遂 由香玲
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 农学
• 关键词: 小黑杨 基因组 SSR
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 156-160
• 页数: 5页
• 分类号: S792.119
• 字数: 4283字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2019.01.019

摘要

小黑杨是人们以小叶杨和欧洲黑杨为亲本培育出的杂交种,兼具双亲生长速度快、抗性强的优点.本研究通过二代测序技术,对小黑杨进行全基因组测序,初步组装出小黑杨基因组,并以此为基础,识别分析其SSR序列,为小黑杨品种划分、表型性状关联等提供参考.结果表明,共组装得到了366 876条总计368.96 Mbp的contig序列;对其中不小于2000 bp的21 788条的非冗余contig进行SSR分析,共识别出18 111条SSR序列,其中一、二、三核苷酸重复基序较多.对得到的SSR序列设计引物,共得到12 838对引物,供今后实验使用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	由香玲	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	35	374	7.0	19.0
2	李开隆	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	24	201	7.0	14.0
3	刘轶	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	9	5	1.0	2.0
4	王遂	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	7	18	3.0	4.0
5	周玉敏		13	21	3.0	4.0