基于分子生物信息学分析小麦球蛋白的理化特性与结构预测

• 作者: 刘中文 刘效谦 王金水 耿瑞蝶 贾峰 陈雨
• 来源期刊: 河南工业大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 小麦 球蛋白 生物信息学分析 理化特性 结构预测
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 粮油食品研究
• 页码范围: 1-8,74
• 页数: 9页
• 分类号: TS201.2
• 字数: 2869字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-2383.2019.02.002

摘要

为探讨小麦球蛋白在理化特性及分子结构方面的共性与特性,基于NCBI蛋白质数据库,利用Protparam、Clustalw、MEME program3、PSIPRED 3.3等软件对8条小麦球蛋白的理化性质、多序列比对、系统进化树、保守基序、蛋白质二级结构、域结构、折叠域识别等进行预测分析.结果表明:小麦球蛋白的氨基酸残基数为225～637,分子质量为24.55～72.25 kDa,理论等电点为5.22～8.72,总平均亲水性为-1.074～0.045,不稳定系数为36.02～77.64,脂肪系数为57.05～96.09.在多序列比对方面,小麦球蛋白存在较多保守区域;在基序分析方面,小麦球蛋白中有6个保守的基序;在结构预测方面,小麦球蛋白的域结构和折叠域差异较小;在蛋白质二级结构方面,氨基酸残基在225～241之间的小麦球蛋白由α-螺旋和无规则卷曲等结构元件组成,基本上不存在延伸链;氨基酸残基在504～637之间的小麦球蛋白则由α-螺旋、延伸链和无规则卷曲等结构元件组成,且三者的比例约为无规则卷曲∶延伸链∶α-螺旋=3∶1∶1.这些结果可为小麦球蛋白的分离纯化及其利用提供生物学数据参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王金水	河南工业大学生物工程学院	176	1165	17.0	26.0
2	贾峰	河南工业大学生物工程学院	61	178	7.0	11.0
3	刘效谦	河南工业大学生物工程学院	5	10	2.0	3.0
4	耿瑞蝶	河南工业大学生物工程学院	4	8	1.0	2.0
5	刘中文	河南工业大学生物工程学院	1	1	1.0	1.0
6	陈雨	河南工业大学生物工程学院	2	1	1.0	1.0