山西省吉县刺槐无性系种质遗传多样性的EST-SSR分析

• 作者: 刘佳平 孙宇涵 李云 李秀宇 牛东升 王红生 董黎 郭琪
• 来源期刊: 北京林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 刺槐 EST-SSR 遗传多样性 聚类分析
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 林学
• 页码范围: 39-48
• 页数: 10页
• 分类号: S718.46|S792.27
• 语种: 中文
• DOI: 10.13332/j.1000-1522.20190108

摘要

[目的]了解各对EST-SSR引物检出的等位简单序列重复片段数量,解析吉县良种基地刺槐无性系种质的多态性状况与种质间亲缘关系,为引物利用和刺槐种质遗传管理提供参考.[方法]利用课题组开发的45对EST-SSR引物进行PCR扩增,使用毛细管电泳仪对产物进行检测,用Popgene 1.32版软件对群体遗传参数进行评估,利用NTsys 2.10e进行聚类分析.[结果]45对EST-SSR引物中,除了引物RP-24均表现出良好的多态性.44对引物共检测到等位重复序列298个,每对引物检测到2～15个,平均6.77个.群体观测杂合度(Ho)的变化范围为0.022 7 ～ 0.842 1,平均为0.412 6.期望杂合度(He)的变化范围为0.088 7 ～ 0.822 3,平均为0.484 0.引物多态性信息量(PIC)变化范围为0.085 2 ～ 0.796 6,平均为0.444 4.[结论]该基地的刺槐无性系种质具有较高的遗传多样性.由聚类结果可知,在遗传距离为0.81时,可将96份刺槐无性系种质聚成5类.聚类图在分子水平上显示了刺槐无性系种质间的亲缘关系,研究结果对于利用这些引物用于刺槐的种质评价、资源管理和辅助育种有积极的参考价值.