菠萝蜜EST-SSR标记开发及其种质资源遗传多样性分析

• 作者: 叶春海 李映志 陈亮 顾洪涛
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 菠萝蜜 EST-SSR 遗传多样性 种质资源
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 135-139
• 页数: 5页
• 分类号: S602
• 字数: 3029字
• 语种: 中文

摘要

[目的]分析菠萝蜜EST-SSR标记的稳定性和多态性揭示能力,并将其用于菠萝蜜种质资源遗传多样性研究.[方法]利用已获得的菠萝蜜cDNA文库中的EST序列,通过搜索SSR序列,设计引物,PCR扩增后,银染检测扩增结果.[结果]设计开发出479对EST-SSR引物,其中399对能在菠萝蜜上扩增出产物,282对具有多态性,多态性扩增引物占58.87％;从中选择60对能够清晰扩增的多态性引物,对64份菠萝蜜种质资源进行遗传多样性分析,60对EST-SSR引物共扩增出188条带,不同引物的扩增条带数在2～11,平均3.13条;其中有168条为多态性条带,多态率为89.36％;每对引物的多态信息含量(PIC)为0.407 7～0.958 9,平均PIC为0.792 2,这说明供试材料具有较高的遗传多样性.系统聚类分析结果表明,在相似系数0.688 1处,可将64份菠萝蜜种质资源分成二天类群,在相似系数0.732 5处,第二大类群又可分为4个亚群.[结论]EST-SSR标记的多态性揭示能力强,用于分析菠萝蜜种质遗传多态性的能力强,其应用前景广阔.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶春海		84	712	13.0	22.0
2	李映志		63	534	12.0	20.0
3	陈亮		15	52	4.0	6.0
4	顾洪涛		1	4	1.0	1.0