几条热点DNA条形码序列对海南大戟科植物鉴定能力比较

• 作者: 唐历波 徐腊红 李栎 陆籽豪
• 来源期刊: 广东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大戟科 DNA条形码 ITS2 rbcL 鉴定
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 作物栽培·遗传育种
• 页码范围: 27-33
• 页数: 7页
• 分类号: S567
• 字数: 4737字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16768/j.issn.1004-874X.2019.09.004

摘要

[目的]比较ITS2、ITS、psbA-trnH、rbcL、matK序列对海南大戟科植物的鉴定能力.[方法]利用PCR测序法对供试样本目的片段进行双向测序,所得序列经Codon Code Aligner拼接后,利用MEGA 6.0进行相关数据分析,利用TAXON DNA软件分析序列种内、种间变异并作barcoding gap分析.[结果]5条候选序列的序列获得率分别为86.96％、76.81％、89.86％、79.71％、49.28％;ITS2序列的变异系数和信息位点系数最大;ITS2序列存在明显的barcoding gap,种间与种内变异分布呈两边分开的趋势.ITS序列虽存在barcoding gap,但种内变异和种间变异有较多的重叠区;psbA-trnH和matK序列barcoding gap均不明显,同时种内变异和种间变异有较多的重叠区;rbcL序列虽barcoding gap不明显,但种内变异和种间变异重叠比例较小.[结论]ITS2条形码序列对海南大戟科植物鉴定能力强,rbcL序列不能作为单独的条形码鉴定物种,但可以作为ITS2的补充条形码.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐历波	海南医学院基础医学与生命科学学院	13	67	4.0	7.0
2	李栎	海南医学院基础医学与生命科学学院	19	70	4.0	7.0
3	徐腊红		1	0	0.0	0.0
4	陆籽豪	海南医学院高等职业教育学院	1	0	0.0	0.0