棉花SBP家族基因的鉴定与分析

• 作者: 张延召 张欢欢 郑玲
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 SBP家族基因 生物信息学 基因结构 功能分析
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 作物栽培·遗传育种
• 页码范围: 39-48
• 页数: 10页
• 分类号: S562
• 字数: 4406字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2019.03.006

摘要

为研究棉花Squamosa启动子结合蛋白(SBP)家族成员的结构和功能,利用生物信息学方法,从棉花全基因组数据库中筛选并鉴定出83个棉花SBP家族成员,命名为GhSBP1—GhSBP83.并对该家族成员的蛋白质理化性质、多序列比对、系统进化树、基因染色体分布、基因结构、基因表达模式进行了全面分析.结果表明,棉花SBP转录因子家族可以分为8个亚族.棉花SBP基因分布在1—8号染色体以及11—13号染色体上.对NCBI中陆地棉的EST数据库进行比对分析,结果显示,40个棉花SBP转录因子家族成员在棉花的分生组织、茎、花、花芽、花药以及棉纤维中广泛表达.其中,GhSBP2、GhSBP4、GhSBP6等20多个基因在花药和棉纤维中均有表达,推测花药和棉纤维的生长发育可能同时受这些基因的控制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑玲	洛阳师范学院生命科学学院	31	88	5.0	8.0
2	张延召	洛阳师范学院生命科学学院	10	4	1.0	2.0
3	张欢欢	洛阳师范学院生命科学学院	1	0	0.0	0.0