HLA新等位基因A?02:355序列及其编码蛋白分子三维结构模拟分析

• 作者: 乔文本 刘艳 朱传福 朱海峰 聂向民
• 来源期刊: 中国免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 人类白细胞抗原 测序分型 新等位基因 模拟分析
• 年，卷（期）: 2019,（13）
• 所属期刊栏目: 基础免疫学
• 页码范围: 1559-1563
• 页数: 5页
• 分类号: R392.2
• 字数: 3721字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-484X.2019.13.005

摘要

目的:鉴定分析HLA新等位基因A?02:355的序列变异并预测分析其氨基酸残基改变在编码蛋白分子三维空间结构中的影响.方法:应用Luminex SSO流式、PCR-SBT及单等位基因特异性测序对1例A位点变异序列进行鉴定.应用Phyre2蛋白折叠识别在线服务器以及RasMol和PDB Protein Workshop分析软件,对其编码蛋白分子三级结构及其氨基酸残基改变特点在MHC分子三维空间结构中所处位置及可能影响进行模拟分析.结果:相较于A?02:03:01,其第98、102位核苷酸发生T->A、A->C替代,导致其编码氨基酸发生9F→Y改变.其编码蛋白分子三维结构模拟分析表明,该氨基酸变异位置位于α1和α2结构域抗原多肽结合凹槽β折叠片层底面的第1β股链的中心位置,该位置亦参与构成抗原多肽结合凹袋B和凹袋C.结论:该等位基因序列被WHO HLA命名委员会正式命名为A?02:355.分析预测此编码氨基酸改变将可能影响其MHC分子的抗原多肽结合及呈递功能.