鸟嘌呤与氨基酸残基体系的极化力场

• 作者: 刘翠 孙照琦 杨忠志 潘明玉 许炎 韩冰玉 韩成娟
• 来源期刊: 高等学校化学学报
• 学科: 化学
• 关键词: 极化力场 氢键 碱基 氨基酸残基
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 物理化学
• 页码范围: 288-297
• 页数: 10页
• 分类号: O641
• 字数: 7564字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7503/cjcu20180653

摘要

发展了应用于鸟嘌呤G和氨基酸残基体系的浮动电荷力场,该力场明确定义了孤对电子和键的电荷和位置,通过电荷随着环境的浮动来体现极化效应;通过氢键拟合函数kHB描绘了氢键键能.应用量子化学方法,对G与氨基酸残基体系从氢键、几何结构及电荷分布3个方面展开计算及分析,并以其为基准,确定参数发展了适用于G与氨基酸残基氢键体系的ABEEMσπPFF.采用3种不同力场模拟目标分子的结构和性质.模拟结果表明,发展的ABEEMσπPFF与量子化学方法具有最好的一致性,可用于模拟生物大分子体系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨忠志	辽宁师范大学化学化工学院	148	620	12.0	15.0
2	刘翠	辽宁师范大学化学化工学院	27	84	5.0	7.0
3	韩冰玉	辽宁师范大学化学化工学院	2	2	1.0	1.0
4	许炎	辽宁师范大学化学化工学院	2	1	1.0	1.0
5	韩成娟	辽宁师范大学化学化工学院	1	1	1.0	1.0
6	潘明玉	辽宁师范大学化学化工学院	1	1	1.0	1.0
7	孙照琦	辽宁师范大学化学化工学院	1	1	1.0	1.0