应用RNA-seq技术检测肺癌与癌旁组织差异表达基因分析

• 作者: 刘莹 安输 彭俊 徐天瑞 曾红 杨泽平 杨洋 郝倩 郭晓汐
• 来源期刊: 临床与实验病理学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肺肿瘤 转录组测序 差异表达基因 细胞增殖 细胞黏附
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 短篇论著
• 页码范围: 852-855
• 页数: 4页
• 分类号: R734.2
• 字数: 2290字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13315/j.cnki.cjcep.2019.07.026

摘要

目的 应用RNA-Seq技术分析肺癌与癌旁组织的差异基因表达,寻找与肺癌发病相关的基因,探讨肺癌的发病机制.方法 对5例ⅡA期肺癌及癌旁组织进行转录组测序,获得差异表达基因集,采用qRT-PCR法检测10例肺癌(对照组)及癌旁组织中的6个关键基因(TFPI2、DKK1、CX3CL1、PSCA、DUOXA2、VSIG1)进行验证.结果 ⅡA期肺癌与癌旁组织共有123个差异表达基因,其中上调基因35个(28.5％),下调基因88个(71.5％).qRT-PCR结果表明,与细胞增殖、凋亡和黏附相关基因TFPI2、DKK1、CX3CL1表达上调,PSCA、DUOXA2、VSIG1表达下调,该检测与RNA-Seq检测结果一致.结论 ⅡA期肺癌与癌旁组织中共有123个差异表达基因,细胞增殖、凋亡、黏附和代谢相关基因参与肺癌的发生、发展,为肺癌的发病机制提供参考.