N6-甲基腺苷参与砷致人体肺癌过程的生物信息学分析

• 作者: 孙东雷 张遵真 李欣洋 赵田禾
• 来源期刊: 现代预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: N6-甲基腺苷 砷 肺癌 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 疾病预防控制
• 页码范围: 552-557
• 页数: 6页
• 分类号: R181.2+3
• 语种: 中文

摘要

目的 探究N6-甲基腺苷(m6A)修饰参与人体砷暴露致肺癌的可能性,为m6A修饰在预防与控制砷致癌的作用及机制研究提供线索.方法 从GEO数据库获取29份饮水砷暴露志愿者RNA表达谱数据与氧化应激的人源细胞样本表达谱数据,采用差异基因分析工具GEO2R筛选差异表达基因,并通过ClueGO和DAVID系统对差异表达基因进行功能注释;从癌症基因组图谱数据库获取59份正常志愿者基因表达谱数据与515份肺腺癌患者基因表达谱数据,采用Ualcan分析系统对肺腺癌患者m6A相关酶的表达水平以及预后进行分析.结果 RNA代谢过程与甲基转移酶活性分别是砷暴露差异表达基因的生物过程和分子功能;转录调节是砷暴露与其公认机制氧化应激共同的差异表达基因的生物过程;相比于健康志愿者,m6A甲基化酶(METTL3)与介导m6A修饰基因翻译的m6A结合蛋白(YTHDF1)在早期肺腺癌患者的表达明显升高(P＜0.05),同时,其他m6A甲基化酶(METTL14与WTAP)与去甲基化酶(FTO)明显下调(P＜0.05);m6A去甲基化酶FTO表达水平的高低与肺腺癌患者的预后密切相关(P＜0.05).结论 m6A修饰可能参与人体砷暴露致肺癌的过程并受到m6A甲基化酶、去甲基化酶与m6A结合蛋白的影响.