基于生物信息学楝酰胺A抑制Jurkat细胞增殖的机制

• 作者: 刘苓霜 徐振晔 玄敏 辛晓丽
• 来源期刊: 中成药
• 学科: 医学
• 关键词: 楝酰胺A 白血病 生物信息学 差异基因 信号通路
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 科研报道
• 页码范围: 774-778
• 页数: 5页
• 分类号: R285.5
• 字数: 3107字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-1528.2020.03.044

摘要

目的 基于生物信息学楝酰胺A抑制Jurkat细胞增殖的机制.方法 从高通量基因表达数据库检索Jurkat细胞基因表达微阵列芯片数据集GSE41072,采用配对样本t检验和倍比法筛选DEGs,采用DAVID数据库进行GO分析和KEGG通路分析,采用相互作用基因库检索工具和Cytoscape软件构建PPI网络.结果 共筛选出122个刺激反应DEGs,上调基因98个,下调基因24个.GO基因功能分布结果显示,DEGs多集中于细胞增殖及其调控相关功能基因.KEGG通路分析结果显示,Rap1信号通路和过氧化物酶体增殖剂激活受体(PPAR)信号通路被显著富集,DEGs富集最多、最显著的是Rap1信号通路.PPI网络分析筛选出节点度最高的前10个中心蛋白编码基因分别是EGFR、VEGFA、GNGT2、PPARG、NCL、GNAO1、CNR1、XRCC5、GPER1、S1PR3.其中,节点度最高的中心蛋白编码基因为EGFR.结论 通过再次分析楝酰胺A干预Jurkat细胞后的芯片数据,筛选出与楝酰胺A抗T淋巴细胞瘤白血病相关的2条信号通路和10个中心蛋白编码基因;Rap1信号通路和基因EGFR可能在楝酰胺A抗T淋巴细胞瘤白血病机制中发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐振晔	上海中医药大学附属龙华医院肿瘤科	118	796	17.0	24.0
2	刘苓霜	上海中医药大学附属龙华医院肿瘤科	60	517	11.0	22.0
3	辛晓丽	上海中医药大学附属龙华医院肿瘤科	6	13	2.0	3.0
4	玄敏	山东省青岛市第八人民医院药学部	2	3	1.0	1.0