大丽轮枝菌β-1,4-内切木聚糖酶基因的鉴定及生物信息学分析

• 作者: 孙天歌 孙杰 张小雪 张迎春 李艳军 梁其干
• 来源期刊: 西北农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花黄萎病 大丽轮枝菌 β-1,4-内切木聚糖酶 细胞壁降解酶
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 页码范围: 776-786
• 页数: 11页
• 分类号: S64
• 字数: 9519字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1004-1389.2020.05.015

摘要

为了挖掘大丽轮枝菌β-1,4-内切木聚糖酶基因,通过生物信息学手段对其进行基因组水平鉴定和系统进化及表达模式分析.结果 表明:从大丽轮枝菌全基因组数据库鉴定到11个p1,4-内切木聚糖酶基因,其中4个属于糖苷水解酶10家族,5个属于11家族,2个属于43家族.11个基因随机分布在5个染色体上,其中3号染色体上包含4个基因,形成1个基因簇;其他染色体上仅含有1～2个基因,未形成基因簇.转录组测序表明,VDAG-03790、VDAG-03808、VDAG_03809、VDAG_ 05043和VDAG_06165这5个基因在棉花感病品种根系分泌物培养的大丽轮枝菌中的表达量明显高于其在耐病品种根系分泌物和水培养的样本中的表达量,表明这些基因对棉花感病品种的根系分泌物有明显的响应,暗示它们可能与大丽轮枝菌的致病性相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李艳军	石河子大学农学院	21	97	7.0	9.0
2	梁其干	石河子大学农学院	3	3	1.0	1.0
3	张迎春	石河子大学农学院	2	15	1.0	2.0
4	孙天歌	石河子大学农学院	1	0	0.0	0.0
5	张小雪	石河子大学农学院	1	0	0.0	0.0