利用生物信息学分析筛选胰腺癌发生的潜在基因及机制

• 作者: 吴荣 杨明丽 王倩 蔡炜嵩 陈欢欢 马赛男 黄哲
• 来源期刊: 中国医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 富集分析 胰腺癌 基因 分子机制
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 134-138
• 页数: 5页
• 分类号: R735.9
• 字数: 2626字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12007/j.issn.0258-4646.2020.02.009

摘要

目的 通过生物信息学的方法 分析胰腺癌发生的潜在机制.方法利用GEOquery分析差异基因表达,利用clusterProfiler进行富集分析.利用STRING数据库进行蛋白相互作用分析.通过TCGA数据库对核心基因进行预后分析.结果 通过差异分析得到277个差异基因.通过富集分析发现,低表达基因主要和胆固醇代谢过程、酒精代谢过程以及消化有关,高表达基因主要和消化系统过程有关.蛋白相互作用分析后找到胰腺癌发生的10个核心基因(ALB、EGF、FN1、COL1A1、COL3A1、ITGA2、CO-L17A1、CEL、PRSS1和TOP2A).经过TCGA数据库预后分析发现3个基因(COL17A1、ITGA2、TOP2A)和预后相关.结论 发现了10个胰腺癌发病风险相关的核心基因和3个预后相关基因.这些核心基因可能可以作为胰腺癌发病预测的靶标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴荣	中国医科大学附属盛京医院第二肿瘤内科	84	538	13.0	17.0
2	王倩	中国医科大学附属盛京医院第二肿瘤内科	75	528	12.0	20.0
3	蔡炜嵩	中国医科大学附属盛京医院第二肿瘤内科	30	87	6.0	8.0
4	黄哲	中国医科大学附属盛京医院普通外科	7	9	2.0	2.0
5	杨明丽	中国医科大学附属盛京医院第二肿瘤内科	6	14	3.0	3.0
6	马赛男	中国医科大学附属盛京医院第二肿瘤内科	9	29	3.0	5.0
7	陈欢欢	中国医科大学附属盛京医院第二肿瘤内科	4	8	1.0	2.0