朝仓花椒DIR基因家族的鉴定及分析

• 作者: 王润英 赵德刚 赵懿琛 陈炳竹
• 来源期刊: 山地农业生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 朝仓花椒 DIR基因家族 生信分析
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 21-26
• 页数: 6页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 3007字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15958/j.cnki.sdnyswxb.2020.02.003

摘要

本研究通过NCBI的BLAST比对分析,最终从朝仓花椒转录组数据库筛选出28条朝仓花椒Dirigent(DIR)蛋白家族的编码基因序列.利用MEGA、MEME、DNAMAN等软件对该蛋白家族进行生物信息学分析,结果显示:从朝仓花椒转录组中获得的28个DIR基因,经过鉴定,在进化上分为6个小组,每个小组的基因数量分别为7、5、1、0、5、10.该家族的蛋白等电点均小于7,均偏酸性,且多数属于稳定蛋白.多基因序列比对比发现,该家族蛋白均具有一个高保守性的DIR结构域.空间结构的分析预测ZpDIR蛋白多为多链线性折叠卷曲蛋白,且以线性无链非规则多链卷曲蛋白为主.