小豆AP2/ERF基因家族鉴定及其应答锈菌侵染的表达分析

• 作者: 刘国辉 左豫虎 康静 张盼盼 张金鹏 徐晓丹 曹鸣宇 杨阳 柯希望 殷丽华 郭永霞
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 小豆 小豆锈病 豇豆单胞锈菌 转录因子
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 细胞生物学、生理学、生物化学、分子生物学
• 页码范围: 394-404
• 页数: 11页
• 分类号: S435.21
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000462

摘要

为明确小豆VaAP2/ERF家族基因在小豆应答豇豆单胞锈菌(Uromyces vignae)侵染中的作用,本研究采用生物信息学方法从小豆基因组中鉴定VaAP2/ERFs家族基因186个,包括AP2(24个)、RAV(2个)、Soloist(1个)及ERF(159个)四个亚家族,其中ERF亚家族又可分为DREB和ERF两个亚类.基因结构分析发现,68.3％的VaAP2/ERFs基因不具内含子.保守基序分析发现,各亚族成员保守域组成类似,可作为基因家族分类的重要依据.前期转录组测序发现VaAP2/ERF中的6个成员接种后24 h显著上调,进一步应用qPCR技术对其在'1-D-3'(免疫)及'宝清红'(感病)中应答锈菌侵染的表达分析发现,免疫品种中6个成员均于接种后6h及120 h显著上调,另有2个于接种后12 h也显著上调,表明上述基因均在小豆抗锈病中发挥正调控作用.