肾上腺皮质癌相关差异表达基因的生物信息学分析

• 作者: 刘海浪 刘萧 王新光 陈志强
• 来源期刊: 现代泌尿生殖肿瘤杂志
• 关键词: 肾上腺皮质癌 生物信息学分析 差异基因 基因芯片
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 70-75
• 页数: 6页
• 字数: 3286字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3870/j.issn.1674-4624.2020.02.002

摘要

目的 利用生物信息学方法分析肾上腺皮质癌的基因芯片数据,筛选并验证肾上腺皮质癌发生相关的关键基因.方法 从公共基因表达数据库下载肾上腺皮质癌相关芯片数据,应用R语言中的Limma程序包筛选差异表达基因,对差异表达基因进行功能富集分析、通路分析及蛋白互作网络构建,然后利用Cytoscape软件进行关键基因筛选,最后利用基因表达分析数据库验证关键基因的表达,并进行患者生存曲线分析.结果 筛选出差异表达基因469个,上调基因253个,下调基因216个.通路分析显示差异基因主要富集在细胞周期、代谢途径、P53信号通路等.蛋白互作网络筛选出GAPDH、CDK1、CCNB1、AURKA、TOP2A及CDC20六个关键基因,这六个关键基因在肾上腺皮质癌中的表达均显著上升,且除了GAPDH外,其余五个关键基因与患者预后不良显著相关.结论 筛选出的关键基因有助于我们进一步了解肾上腺皮质癌的发生机制,并且可用做肾上腺皮质癌早期检测的分子标记物和免疫治疗的潜在靶标.