花生1,3,4-三磷酸肌醇5/6激酶ITPK家族基因的鉴定和分析

• 作者: 于海秋 任婧瑶 张鹤 李新林 蒋春姬 金华
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 花生 1,3,4-三磷酸肌醇5/6激酶(ITPK) 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·生物技术
• 页码范围: 432-440
• 页数: 9页
• 分类号: S565.2
• 字数: 4825字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19802/j.issn.1007-9084.2019181

摘要

1,3,4-三磷酸肌醇5/6-激酶(ITPK)是一种保守的多功能酶,调控磷酸肌醇的代谢过程,广泛存在于动植物和线虫中.本研究从两个野生种花生基因组(Arachis duranensis和Arachis ipaensis)中获得AdITPK家族基因7个,AiITPK家族基因7个,利用生物信息学手段,系统地分析花生ITPK家族基因生物学特征.结果表明,AdITPKs和Ai-ITPKs基因的染色体定位相似,在03号和05号染色体上都分别有2个ITPK家族成员,AdITPKs在A01、A08和A10号染色体上各1个,AiITPKs在B01、B07和B10号染色体上各1个;花生各ITPK基因含外显子数量在1～10个不等,可编码220～483个氨基酸;进化关系分析显示花生ITPK家族基因可分为3个亚家族;基于保守结构域分析显示,此家族蛋白含有4～6个保守结构基序.两基因组同源基因的二级结构相似性较大,而AdITPK5和AiITPK5、AdITPK6和AiITPK6两对同源基因例外;大部分基因的三级结构皆相似,但AdITPK1、AdITPK6、AiITPK1和AiITPK6与其余基因明显不同;花生ITPK家族基因在各器官中表达量不同,在发育前期的种子、根系和根瘤中表达较高.本研究为花生ITPK基因的后续研究奠定理论基础,为明确ITPK对花生生长中的调控作用提供了依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	金华		87	424	9.0	17.0
2	于海秋		54	754	15.0	26.0
3	蒋春姬		37	276	10.0	14.0
4	张鹤		10	24	3.0	4.0
5	李新林		8	16	3.0	3.0
6	任婧瑶		2	1	1.0	1.0