龙眼BR/1基因家族的全基因组鉴定及光照响应表达

• 作者: 姚德恒 孙刚 李汉生 林玉玲 赖钟雄 陈晓慧
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 关键词: 龙眼 BRI1基因家族 成员鉴定 光照 miRNA预测 表达
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 125-134
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.19675/j.cnki.1006-687x.2019.07053

摘要

为了解龙眼BRI1基因家族的生物学功能及响应光照机制,对其BRI1基因成员鉴定、基因结构、蛋白保守结构域、启动子顺式作用元件、互作miRNA预测、不同体胚发生阶段和不同组织器官的FPKM值及其响应光照表达模式等进行分析.结果表明:DIBRI1基因家族包含4个成员,分别命名为DIBRI1-1、DIBRI1-2a、DIBRI1-2b和DIBRI1-3.DIBRI1是一种无内含子基因,无内含子基因在转录的过程中不需要经历内含子的剪切步骤,是响应外界因素的一种快速应答基因.龙眼BRI1蛋白家族为植物富亮氨酸重复类受体蛋白激酶的一种,其在植物激素信号转导和非生物胁迫中具有重要调控作用.龙眼BRI1四个家族成员启动子均含有大量的光响应元件、激素应答元件、非生物胁迫响应元件,表明龙眼BRI1家族基因可能是连接光信号转导与激素信号转导的重要纽带.DIBRI1-3为miR390e的靶基因.FPKM值分析表明,DIBRI1-1和DIBRI1-3在体胚发生过程和不同组织部位中均呈现高表达,推测DIBRI1-1和DIBRI1-3可能在龙眼整个生长发育过程中起到更为关键的作用.荧光定量PCR结果推测,蓝光信号使得miR390的表达量显著减少,导致靶基因BRI1-3的表达量增加,从而影响油菜素内脂从属基因BZR1、转录因子PIF4,进而影响龙眼功能性代谢产物积累.本研究表明DIBRI1具有功能多样性,可能在龙眼响应光信号、激素信号、非生物胁迫及代谢调控中发挥作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙刚		10	2	1.0	1.0
2	李汉生		3	0	0.0	0.0
3	陈晓慧		1	0	0.0	0.0
4	姚德恒		1	0	0.0	0.0
5	林玉玲		1	0	0.0	0.0
6	赖钟雄		1	0	0.0	0.0