甜菜西方黄化病毒两个山东辣椒分离物全基因组扩增及序列分析

• 作者: 刘晓莹 周涛 孙晓辉 张先平 竺晓平 臧连毅
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甜菜西方黄化病毒 全基因组 系统进化树 辣椒 病毒病
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 细胞生物学、生理学、生物化学、分子生物学
• 页码范围: 584-591
• 页数: 8页
• 分类号: S432.41
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000438

摘要

通过RACE和RT-PCR技术相结合的方法,在山东省潍坊市和济宁市辣椒上克隆出2个甜菜西方黄化病毒(beet western yellows virus,BWYV)的全基因组序列,基因组全长均为5 699 nt.与GenBank比对发现,2个分离物的5'UTR(Untranslated region,UTR)变异程度小、相对比较保守,而3'UTR变异程度大、为突变热点区域.潍坊、济宁两地分离物与GenBank中该病毒的全基因组序列相似度平均值分别为89.89％和89.72％.系统进化树分析发现BWYV亚洲地区的分离物聚类在3个不同的组别,本研究克隆的2个山东分离物和3个日本分离物(LC428355、LC428356、LC428357)、2个韩国分离物(LC198684、KM076647)聚在一组,而美国分离物与法国分离物聚在其他分支,表明该病毒的进化存在地理相关性.这是首次对BWYV中国辣椒分离物的全基因组序列克隆,丰富了BWYV的序列信息,有助于进一步了解该病毒种群的遗传进化关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周涛		41	527	11.0	22.0
2	孙晓辉		4	25	1.0	4.0
3	臧连毅		1	0	0.0	0.0
4	刘晓莹		1	0	0.0	0.0
5	张先平		1	0	0.0	0.0
6	竺晓平		1	0	0.0	0.0