基于生物信息学途径评估UBE2家族及UBE2T基因在肺腺癌中的表达及临床意义

• 作者: 杨豪帅 林晓平 赖慧娜 饶怡茹
• 来源期刊: 中山大学学报（医学科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 肺腺癌 UBE2T UBE2家族 基因表达 数据库 泛素化 糖代谢
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 445-451
• 页数: 7页
• 分类号: R73
• 字数: 3849字
• 语种: 中文

摘要

[目的]探究泛素结合酶E2家族和泛素结合酶E2T(UBE2T)在肺腺癌中的表达情况及其与临床病理特征之间的关系.[方法]利用linkedomics平台进行UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA表达水平与肺腺癌临床特征之间的关系分析,对总生存时间(OS;Cox回归检验)、总分期(Kruskal-Wallis H检验)、T分期(Kruskal-Wallis H检验)、N分期(Kruskal-Wallis H检验)及M分期(Wilcox秩和检验)进行差异比较.运用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库获取UBE2T基因在肺腺癌组织和癌旁组织中的表达信息,将结果进行两独立样本t检验.利用GSEA软件进行KEGG通路及富集分析.[结果]UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA表达量与肺腺癌的临床病理特征存在相关关系.其中,UBE2T高表达者其OS较短,TNM分期较晚者UBE2T呈高表达,差异均具有统计学意义(P<0.05).UBE2T mRNA表达量在肺腺癌中明显升高(P<0.01).基因富集结果显示高表达的UBE2T与细胞周期(FDR=0),剪接体(FDR=0),DNA修复(FDR=0)及糖代谢等36个信号通路密切相关(FDR<0.05).UBE2家族的UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA均与肺腺癌的临床病理特征存在相关关系,其中UBE2T的表达水平与临床分期及预后的关系最为密切,且与肿瘤细胞糖酵解通路密切相关.[结论]UBE2家族与肺腺癌临床病理特征相关.UBE2T mRNA有望成为肺腺癌新的生物标志物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林晓平	中山大学肿瘤防治中心核医学科	13	51	4.0	6.0
2	杨豪帅	中山大学中山医学院	3	0	0.0	0.0
3	赖慧娜	中山大学中山医学院	3	0	0.0	0.0
4	饶怡茹	中山大学中山医学院	1	0	0.0	0.0