扬子鳃蛭线粒体基因组全序列测定及其系统学地位——基于Pacbio和Illumina技术

• 作者: 谷生丽 刘谏君 孙恩涛 湛孝东 聂刘旺
• 来源期刊: 吉首大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 扬子鳃蛭 线粒体基因组全序列 蛭纲 Pacbio和Illumina测序
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 生物与化学化工
• 页码范围: 28-35
• 页数: 8页
• 分类号: S855.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.13438/j.cnki.jdzk.2020.03.006

摘要

利用Illumina和Pacbio测序技术对扬子鳃蛭(Ozobranchus jantseanus)线粒体基因组全序列进行测序及注释,并与NCBI数据库中蛭纲(Hirudinea)其他物种的线粒体全序列的排列方式和系统进化关系进行了比较,以确定其系统学地位.结果显示:获得的线粒体基因组序列长度为14 868 bp,蛋白编码基因存在2种起始密码子,分别为ATG和ATT;终止密码子共有4种,分别为TAA,TAG,TA和T;蛭纲10个物种的线粒体基因组全序列基因排序可分为2种类型,其差异表现在tRNAs的互换和长非编码区的长度的不同;扬子鳃蛭所属的吻蛭目(Rhynchobdellida)均为b型,绝大部分无吻蛭目(Arhynchobdellida)的排列方式为a型.基于蛭纲物种的13个蛋白编码基因(PCGs)的Neighbor-Joining (NJ)树进化分析显示,扬子鳃蛭与其他吻蛭目物种聚类.