地果的转录组学分析

• 作者: 刘燕 张婷 欧阳柏成 王继玥 白禹 石登红
• 来源期刊: 热带亚热带植物学报
• 关键词: 转录组 地果 RNA-seq 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 317-328
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11926/jtsb.4164

摘要

为探究地果(Ficus tikoua)的遗传变异特征,利用Illumina HiSeq-2500平台获取地果的基因表达谱.结果表明,共获得了197362个转录本,总长度和平均长度分别为114072125和577 bp.使用BlastX和BlastN共注释了139992个转录本(占总数的70.93％).从3个品种叶片和茎的6对样品中,分别鉴定了12397、12340、10373、94431、71830和44465个差异表达基因,以及注释了126、129、125、134、138和137条代谢途径.这将有助于理解地果的遗传特征,以及不同组织中代谢途径的变化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘燕	贵阳学院生物与环境工程学院	89	331	10.0	14.0
2	石登红	贵阳学院生物与环境工程学院	49	149	8.0	9.0
3	欧阳柏成	贵阳学院数学与信息工程学院	23	41	4.0	5.0
4	王继玥	贵阳学院生物与环境工程学院	25	48	4.0	6.0
8	白禹		4	10	1.0	3.0
9	张婷		3	10	1.0	3.0