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木霉菌基因组热激转录因子家族基因特性
木霉菌基因组热激转录因子家族基因特性
作者:
赵诣
田桢
康福思
王爱晶
安一博
郭瑞婷
刘志华
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
生物防治
木霉
热激转录因子
基因特性
生物信息学
摘要:
木霉(Trichoderma)是一种良好的生防因子,为揭示木霉热激转录因子(Heat shock transcription factor)基因的功能并为木霉菌种的改良提供基础数据,通过生物信息学分析方法,在7种9株木霉全基因组水平上鉴定出27个HSTF基因,并选取酿酒酵母中的5个HSTF基因作为对照,对它们的系统发育关系、序列特征、表达情况以及蛋白结构进行详细分析;通过克隆链格孢属(Alternaria alternata)真菌胁迫下HSTFTas基因并分析其表达量.研究结果表明:每株木霉含有3个HSTF基因家族成员,分子质量56.1~81.1 kD,等电点(PI)5.50~8.98.HSTF基因序列特征和系统进化分析将木霉的热激转录因子分为3个分支(Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ).3类热激转录因子的蛋白质三级结构差异较大,总共含有7~8种保守基序.棘孢木霉(T.asperellum)CBS 433.97的3类HSTF基因在链格孢致病毒素胁迫下均有响应,其表达量分别在诱导24 h、24 h和2 h时提高了 1.5、2.6和1.7倍.木霉热激转录因子基因家族有较高保守性,木霉与病原菌互作过程中,木霉的HSTF基因在木霉的响应病原菌胁迫中起了重要作用.
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文献信息
篇名
木霉菌基因组热激转录因子家族基因特性
来源期刊
吉林农业大学学报
学科
关键词
生物防治
木霉
热激转录因子
基因特性
生物信息学
年,卷(期)
2020,(6)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
612-622
页数
11页
分类号
S476
字数
语种
中文
DOI
10.13327/j.jjlau.2019.4581
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基因特性
生物信息学
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研究来源
研究分支
研究去脉
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吉林农业大学学报
主办单位:
吉林农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-5684
CN:
22-1100/S
开本:
大16开
出版地:
吉林省长春市新城大街2888号
邮发代号:
创刊时间:
1979
语种:
chi
出版文献量(篇)
3333
总下载数(次)
5
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