基于生物信息学分析的口腔鳞状细胞癌微小RNA预后模型

• 作者: 朱慧 赵格 郭超 黎昌学
• 来源期刊: 华西口腔医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 口腔鳞状细胞癌 微小RNA 癌症基因组图谱 Cox回归模型 预后模型
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 622-627
• 页数: 6页
• 分类号: R739.8
• 语种: 中文
• DOI: 10.7518/hxkq.2020.06.003

摘要

目的 通过生物信息学筛选并建立与口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者预后相关的微小RNA(miRNA)预后模型,以期对OSCC患者进行精准的分组,提高治疗的针对性.方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载OSCC患者的miRNA、mRNA表达谱和临床数据.采用单因素和多因素Cox风险回归分析筛选和建立miRNA预后模型.受试者工作特征曲线(ROC)和曲线下面积(AUC)检验预后模型的性能.预测6-miRNAs靶基因,与差异mRNA取交集后行基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.构建蛋白互作网络(PPI)筛选中枢基因.结果 通过单因素和多因素Cox回归分析得到基于6个miRNA的预后风险模型.train组、test组和所有样品组中预测5年生存率的ROC曲线下AUC值分别为0.757、0.673、0.724.单因素和多因素Cox回归分析显示,6-miRNAs预后模型可以作为一个独立的预后因素(P<0.001).靶基因构建PPI网络中前10个中枢基因为CCNB1、EGF、KIF23、MCM10、ITGAV、MELK、PLK4、ADCY2、CENPF、TRIP13.其中EGF和ADCY2与生存预后相关(P<0.05).结论 6-miRNAs可有效地作为OSCC患者一种新的独立的预后模型,或可成为指导OSCC精准治疗的新方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黎昌学		15	21	3.0	4.0
2	赵格		1	0	0.0	0.0
3	郭超		1	0	0.0	0.0
4	朱慧		1	0	0.0	0.0