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应用UPLC-QTOF-MS/MS技术测定肝细胞癌患者血清代谢组
应用UPLC-QTOF-MS/MS技术测定肝细胞癌患者血清代谢组
作者:
王淑凤
柏兆方
杨馨
王心正
何昆
王红霞
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
肝癌
血清
超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱联用技术
代谢组
摘要:
目的 通过比较肝细胞癌(HCC)和肝硬化(LC)患者血清代谢物,研究HCC代谢谱变化,为寻找HCC早期诊断标志物及治疗新靶点和策略提供依据.方法 收集HCC和LC患者血清各50例,应用超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱联用技术(UPLC-QTOF-MS/MS)对血清代谢物进行鉴定和定量.液相色谱分离采用反相色谱(RPLC)和亲水色谱(HILIC)2种模式,质谱采集包括正、负2种离子化方式.应用Progen?esis QI软件进行数据处理,应用EZinfo软件进行主成分分析和正交偏最小二乘判别分析等多元统计分析并筛选差异代谢物.代谢物鉴定通过检索人代谢组数据库(HMDB)和Metlin数据库实现.应用MetaboAna?lyst 4.0对差异代谢物进行代谢通路分析.结果 应用UPLC-QTOF-MS/MS技术,共检测到87610个特征代谢峰,鉴定出7848种代谢物.通过P<0.05,变量重要性投影指标(VIP)值≥1及HCC与LC比较的差异倍数≥1.5或≤0.67等3个条件筛选出差异代谢物438个,主要包括磷脂、胆汁酸、游离脂肪酸、小肽和氨基酸等,涉及12个代谢通路的变化.结论 与LC患者比较,HCC患者的血清代谢组发生显著变化,共有438种差异代谢物参与12个代谢通路的变化,这有助于发现早期诊断标志物和药物靶标.其中50个差异代谢物具有较高的临床诊断价值,值得进一步验证.另外,本研究近8000个代谢物的鉴定表明,所采用的RPLC结合HILIC分离的UPLC-QTOF-MS/MS技术显著提高了代谢物的鉴定覆盖率,可广泛应用于多领域的代谢组学研究.
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篇名
应用UPLC-QTOF-MS/MS技术测定肝细胞癌患者血清代谢组
来源期刊
中国药理学与毒理学杂志
学科
关键词
肝癌
血清
超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱联用技术
代谢组
年,卷(期)
2020,(12)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
918-929
页数
12页
分类号
R965|R730.3
字数
语种
中文
DOI
10.3867/j.issn.1000-3002.2020.12.004
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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(/年)
引文网络
引文网络
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(3)
参考文献
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肝癌
血清
超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱联用技术
代谢组
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
中国药理学与毒理学杂志
主办单位:
军事医学科学院毒物药物研究所
中国药理学会
中国毒理学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-3002
CN:
11-1155/R
开本:
大16开
出版地:
北京太平路27号
邮发代号:
82-140
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
2901
总下载数(次)
9
总被引数(次)
24241
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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