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摘要:
从湖北省某猪场分离了一株猪蓝耳病毒(CH-WH-19),其基因组全长是14993 bp.同源性分析结果显示CH-WH-19与NADC30、JXAl、CH-la、VR-2332和GM2的相似性分别为91.9%、84.3%、83.9%、83.3% 和80.5%,但是与欧洲型的毒株Lelystad virus 相似性仅有58.9%.GP5基因和全基因组的进化树分析显示,CH-WH-19与NADC30毒株处于同一分支.Nsp2基因氨基酸比对结果发现,CH-WH-19和NADC30毒株与VR2332毒株相比具有不连续的131个氨基酸缺失的特征.同源性和进化树的结果都显示了CH-WH-19属于新变异的类NADC30毒株.GP5序列比对结果表明,CH-WH-19有一些氨基酸的突变,A137是疫苗株VR2332的标志,但CH-WH-19毒株突变成了S,N34是四个潜在的N-糖基化位点之一,突变成了D.试验表明,本研究分离了一株变异的NADC30毒株,生物学特性分析也表明属于类NADC30毒株.
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文献信息
篇名 一株猪蓝耳病毒的分离鉴定及其全基因组序列的比较分析
来源期刊 中国兽药杂志 学科 农学
关键词 猪蓝耳病毒 分离 鉴定 全基因组 进化树
年,卷(期) 2020,(11) 所属期刊栏目 微生物与免疫
研究方向 页码范围 8-13
页数 6页 分类号 S852.65
字数 语种 中文
DOI 10.11751/ISSN.1002-1280.2020.11.02
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