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摘要:
[目的]基于香蕉基因组数据筛选Walls are thin 1(WAT1)基因,分析它们的序列及表达特性.[方法]以拟南芥WAT1为参考序列,通过本地Blast筛选获得香蕉WAT1基因,分析其核苷酸、启动子及编码蛋白特性,并利用实时定量PCR技术研究其在不同组织部位、不同激素和逆境胁迫处理下的表达情况.[结果]筛选获得5个香蕉WAT1基因(命名为MaWAT1-1~5).蛋白亚细胞定位预测结果显示,MaWAT1-1、MaWAT1-2、MaWAT1-4主要定位在液泡和细胞膜上,MaWAT1-3主要定位在细胞质和细胞膜,MaWAT1-5定位在细胞膜和叶绿体.基因结构分析和系统进化树分析均将MaWATs分为两组,MaWAT1-1、MaWAT1-2、MaWAT1-4聚为一组(含6个外显子和5个内含子),MaWAT1-3和MaWAT1-5归为一组(含7个外显子和6个内含子).启动子顺式作用元件分析结果显示:MaWAT1s启动子含有大量激素和胁迫响应相关元件.实时定量PCR结果显示,MaWAT1-4在叶片中表达量最高,MaWAT1-1在根和假茎中表达量最高,其余均在根中表达量最高;大多数MaWAT1s的表达受GA3、SA、盐胁迫和干旱等显著诱导,受高温显著抑制,同时部分成员的表达受IAA、ABA、JA、低温、机械损伤和枯萎病影响显著.[结论]MaWAT1s的表达受多种激素和逆境影响显著,可能在香蕉生长发育和抗逆防御反应中发挥着重要作用.
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文献信息
篇名 香蕉WAT1基因的鉴定及表达分析
来源期刊 果树学报 学科 农学
关键词 香蕉 MaWAT1 基因结构 顺式作用元件 基因表达
年,卷(期) 2020,(5) 所属期刊栏目 种质资源·遗传育种·分子生物学
研究方向 页码范围 645-658
页数 14页 分类号 S668.1
字数 8627字 语种 中文
DOI 10.13925/j.cnki.gsxb.20190576
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节点文献
香蕉
MaWAT1
基因结构
顺式作用元件
基因表达
研究起点
研究来源
研究分支
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
果树学报
月刊
1009-9980
41-1308/S
大16开
河南省郑州市航海东路南中国农业科学院郑州果树研究所
36-93
1984
chi
出版文献量(篇)
3886
总下载数(次)
6
总被引数(次)
85940
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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