转录组测序筛选野生大豆糖代谢途径干旱相关基因及其表达差异分析

• 作者: 乔亚科 乔潇 俎天娇 张小芳 张锴 李桂兰 韩金玲
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 野生大豆 转录组测序 干旱胁迫 糖代谢
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 非生物胁迫
• 页码范围: 623-631
• 页数: 9页
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.19802/j.issn.1007-9084.2019296

摘要

野生大豆较栽培大豆有更广的遗传多样性,在组学水平整体分析其基因表达模式对筛选抗旱关键基因、解析干旱胁迫响应调控网络和促进分子育种具有重要意义.本研究采用高通量测序技术对PEG6000模拟干旱胁迫处理第0 h、6 h、12 h、24 h和48 h的30d苗龄野生大豆RNA进行转录组测序,获得了1796条糖代谢途径相关序列.淀粉和蔗糖代谢途径通路注释的差异基因最多,半乳糖代谢途径次之;在获得的109个差异表达基因中,干旱胁迫处理第12 h差异表达基因最多;对以上109个差异表达基因构建蛋白质相互作用网络,以节点度>10为标准筛选中心节点,共获得8个关键基因.为进一步研究野生大豆干旱胁迫下的糖代谢相关基因奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李桂兰		14	117	5.0	10.0
2	乔亚科		20	132	6.0	11.0
3	韩金玲		20	110	5.0	10.0
4	乔潇		11	33	3.0	5.0
5	俎天娇		4	0	0.0	0.0
6	张锴		8	13	2.0	3.0
7	张小芳		3	0	0.0	0.0