地黄C3 H基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 周延清 朱佳琳 邵露营 郭萌萌
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 地黄 C3H基因 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 药用植物研究与大健康 专刊
• 页码范围: 1281-1287
• 页数: 7页
• 分类号: Q943
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201907060

摘要

香豆酸-3-羟化酶属于植物中最大的蛋白酶细胞色素P450家族之一,在植物生命活动中发挥着重要作用.为了解地黄香豆酸-3-羟化酶基因RgC3H合成毛蕊花糖苷的功能,该研究基于地黄代谢组学分析获得KEGG途径中的C3H,采用多重比对在NCBI中获得同源基因的一个保守序列,并基于该保守序列和地黄SRA数据库,采用电子克隆和RT-PCR克隆技术获得地黄C3H基因全长CDS(RgC3H),对其进行生物信息学分析.结果 表明:RgC3H基因全长为1530 bp,且编码一个含509个氨基酸、分子量为57.91 kD、无信号肽的蛋白质;基于氨基酸序列的结构分析显示,RgC3H有一个保守区域-P450结构域;系统进化分析结果显示,RgC3H与芝麻和猴面花的C3H基因具有很高的同源性.上述结果为进一步研究RgC3H基因在地黄毛蕊花糖苷生物合成途径中的作用奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周延清		85	1261	15.0	33.0
2	郭萌萌		6	4	1.0	2.0
3	邵露营		3	0	0.0	0.0
4	朱佳琳		1	0	0.0	0.0