基于生物信息学的CDK1在肺腺癌中的表达及其意义

• 作者: 刘少博 王思望 郭嘉东 黄波
• 来源期刊: 中国胸心血管外科临床杂志
• 关键词: 细胞周期蛋白依赖性激酶1 (CDK1) 肺腺癌 生物信息学分析 预后
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 胸外科
• 页码范围: 530-538
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.7507/1007-4848.201909003

摘要

目的 通过生物信息学方法分析细胞周期蛋白依赖性激酶1 (CDK1)在肺腺癌中的表达及其临床意义.方法 基于癌症基因组图谱计划(TCGA)中肺腺癌患者基因表达数据分析CDK1在肺腺癌组织和正常肺组织差异表达情况,使用UALCAN分析肺腺癌中CDK1基因在不同角度下的表达差异.利用Kaplan-MeierPlotter进行肺腺癌中CDK1基因高低表达组不同情况下的生存分析.基于TCGA中肺腺癌临床数据进行CDK1表达量与总生存期的相关性Cox分析.对临床病例中与CDK1表达相关的基因序列进行基因富集分析.经STRING获取CDK1来自智人的蛋白相互作用网络.获取CDK1相关基因蛋白,通过在线网站GEPIA进行相关分析.结果 基于对TCGA基因表达数据分析可知CDK1在肺腺癌中表达高于正常肺组织.通过UALCAN分析发现CDK1高表达与吸烟可能有一定的相关性.生存分析提示当CDK1基因高表达时,肺腺癌患者预后较差.将CDK1的表达量与总生存期进行单因素和多因素Cox回归分析示,CDK1高表达是肺腺癌患者生存期的独立危险因素(P=0.00).进行基因富集分析可知CDK1高表达与DNA复制、细胞周期、癌症通路、p53信号通路密切相关.结论 CDK1可能是一种潜在的肺腺癌预后相关的分子标志物.此外,DNA复制、细胞周期、癌症通路、p53信号通路可能与肺腺癌中的CDK1调节有关.