敲减DDX46后食管鳞癌细胞差异表达基因筛选及相互作用的生物信息学分析

• 作者: 冯海明 尹泚 敬涛 朱多杰 李政 李斌 杨建宝 蔺军平
• 来源期刊: 中国胸心血管外科临床杂志
• 关键词: DDX46 食管鳞癌 基因芯片 差异基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 61-67
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.7507/1007-4848.201907051

摘要

目的 探讨DDX46基因对食管鳞癌发生发展的作用机制.方法 应用基因芯片技术检测DDX46基因敲减前后食管鳞癌TE-1细胞中全基因mRNA表达丰度,筛选差异表达的基因,并对其进行生物信息学分析.对表达谱筛选的其中6个差异基因进行实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)定量分析以验证结果的可靠性.结果 按照表达差异倍数之绝对值≥2,且P＜0.05的筛选条件,筛选出差异基因1 006个,其中表达下调基因644个,表达上调基因362个.生物信息分析显示,差异基因主要涉及细胞周期、增殖、凋亡、黏附、能量代谢及免疫应答等生物学过程,磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)为重要节点分子.qRT-PCR检测结果与基因芯片结果的验证符合率为100％.结论 利用生物信息学方法能有效挖掘DDX46敲减后食管鳞癌基因芯片数据,为进一步研究DDX46与食管鳞癌发生发展的关系,以及寻找潜在的治疗靶点提供有价值的线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李斌		115	327	9.0	13.0
2	杨建宝		17	47	3.0	6.0
3	朱多杰		6	5	2.0	2.0
4	冯海明		12	9	2.0	3.0
5	敬涛		11	8	2.0	2.0
6	李政		3	3	1.0	1.0
7	蔺军平		8	25	2.0	5.0
8	尹泚		2	2	1.0	1.0