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杜鹃红山茶实时定量PCR内参基因筛选及验证
杜鹃红山茶实时定量PCR内参基因筛选及验证
作者:
于波
刘小飞
孙映波
黄丽丽
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
实时荧光定量PCR
杜鹃红山茶
内参基因
GeNorm
NormFinder
摘要:
[目的]实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)以高灵敏度和特异性等优点,成为基因表达分析的主要工具,而选择适合不同条件下工作的内参是qRT-PCR分析的前提.筛选得到适用于杜鹃红山茶不同器官、不同时期花瓣的qRT-PCR分析的内参基因,为后续相关基因功能研究提供可用的内参基因.[方法]选择转录延伸因子编码基因(EF1α)、α-tubulin(TUA)、β-tubulin(TUB)、Ubiquitin(UBQ)、肌动蛋白(Actin)和甘油醛-3-磷酸脱氢酶(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)6个看家基因,使用2种不同的计算程序GeNorm和NormFinder评估了6个基因表达的稳定性.进一步通过CaGASA3基因的表达模式验证了所选内参基因的适用性.[结果]在不同器官中通过GeNorm和NormFinder筛选出稳定性最好的基因,排名前2位的均为TUA和GAPDH,GAPDH基因在两种计算程序评估中稳定性均最佳.而在不同时期花瓣中,通过2种程序得出排名前2位的内参基因均为TUB和UBQ;UBQ基因在GeNorm程序评估中稳定性最好,TUB基因在NormFinder程序的评估中稳定性最佳.[结论]杜鹃红山茶不同器官中最佳内参基因为TUA和GAPDH,不同时期花瓣中最适内参基因为TUB和UBQ.
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文献信息
篇名
杜鹃红山茶实时定量PCR内参基因筛选及验证
来源期刊
广东农业科学
学科
农学
关键词
实时荧光定量PCR
杜鹃红山茶
内参基因
GeNorm
NormFinder
年,卷(期)
2020,(12)
所属期刊栏目
环境园艺
研究方向
页码范围
203-211
页数
9页
分类号
S602.4|Q349+.5
字数
语种
中文
DOI
10.16768/j.issn.1004-874X.2020.12.021
五维指标
传播情况
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节点文献
实时荧光定量PCR
杜鹃红山茶
内参基因
GeNorm
NormFinder
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广东农业科学
主办单位:
广东省农业科学院
华南农业大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1004-874X
CN:
44-1267/S
开本:
大16开
出版地:
广州市五山广东省农科院内
邮发代号:
46-43
创刊时间:
1965
语种:
chi
出版文献量(篇)
14242
总下载数(次)
17
总被引数(次)
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