黔北麻羊CTSB、CTSD基因的克隆、生物信息学分析及在不同组织中的表达

• 作者: 周志楠 敖叶 洪磊 陈祥 韦仕南
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 组织蛋白酶B/D基因(CTSB/D) 单、多羔黔北麻羊 生物信息学分析 克隆
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 1836-1846
• 页数: 11页
• 分类号: S813.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2020.09.26

摘要

以单、多羔黔北麻羊为试验对象,采用PCR法扩增克隆获得黔北麻羊CTSB、CTSD基因CDS区序列,生物信息学方法分析黔北麻羊CTSB、CTSD的理化性质、蛋白质高级结构、亚细胞定位情况和信号肽位点,并进行氨基酸同源性分析构建系统进化树;应用qRT-PCR法对目的基因在单、多羔黔北麻羊下丘脑、垂体、子宫、输卵管和卵巢5个性腺组织中的表达量进行差异分析.结果 表明:黔北麻羊CTSB、CTSD基因编码序列全长为1 008和1 239 bp,共编码335和412个氨基酸.其蛋白相对分子质量分别为36 780和44 590,理论等电点为5.65和7.03,不稳定系数为65.16和37.82.CTSB、CTSD蛋白二级结构均主要由无规则卷曲构成;三级结构预测结果与二级结构一致,且CTSB蛋白属于亲水性蛋白,信号肽剪切位点位于第17～18号氨基酸,亚细胞定位发现CTSB蛋白有66.7％的可能定位于细胞外;而CTSD属于疏水性蛋白,信号肽剪切位点位于第22～23号氨基酸,亚细胞定位表明其有44.4％的可能定位于细胞外(包括细胞壁).与其他动物相比,黔北麻羊CTSB、CTSD编码氨基酸序列与绵羊的亲缘性最近.qRT-PCR结果显示,CTSB、CTSD基因在单、多羔黔北麻羊下丘脑、垂体、子宫、输卵管、卵巢5个性腺组织中均有表达,且在卵巢中的表达量最高,极显著高于其他组织(P＜0.01),CTSB基因mRNA在多羔黔北麻羊垂体、子宫中的表达量极显著高于单羔黔北麻羊(P＜0.01),CTSD基因mRNA在多羔黔北麻羊垂体、输卵管、卵巢中的表达量极显著高于单羔黔北麻羊(P＜0.01).本试验揭示了CTSB、CTSD基因在单、多羔黔北麻羊的表达差异并初步分析了其生物学功能,为进一步探究CTSB、CTSD基因的功能与调控机理奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈祥		50	135	6.0	9.0
2	周志楠		1	0	0.0	0.0
3	敖叶		1	0	0.0	0.0
4	洪磊		1	0	0.0	0.0
5	韦仕南		1	0	0.0	0.0