铁皮石斛CSLA基因家族的全基因组鉴定和表达分析

• 作者: 刘京晶 斯金平 陈东红 陈学良 高雅倩
• 来源期刊: 中国中药杂志
• 关键词: 铁皮石斛 葡甘聚糖 CSLA 基因表达 胁迫处理
• 年，卷（期）: 2020,（13）
• 所属期刊栏目: 分子生药学
• 页码范围: 3120-3127
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.19540/j.cnki.cjcmm.20200506.103

摘要

葡甘聚糖是铁皮石斛的标志性成分,它的生物合成主要由CSLA家族基因调控.为了系统评价铁皮石斛CSLA家族成员,通过从NCBI数据库下载铁皮石斛基因组数据,利用生物信息学手段进行DcCSLA基因家族成员的全基因组鉴定、系统进化、基因结构、蛋白质保守结构域和基序、启动子顺式元件、基因表达对胁迫响应的分析.结果 显示铁皮石斛包含13个CS-LA基因家族成员,均包含9～10个外显子;在进化关系中,CSLA被聚为5组,DcCSLA基因分布于所有分支中,其中group Ⅰ的祖先基因在单双子叶植物分化之前已存在,groupⅡ～V仅在单子叶植物存在,说明group Ⅰ代表最早起源的类群;DcCSLA家族蛋白均含有标志性的CESA_CaSu_A2结构域;它们的启动子区域包含与胁迫和激素相关的顺式调控元件;胁迫处理下,低温诱导DcCSLA5的表达,抑制DcCSLA3的表达;翠雀小核菌侵染抑制DcCSLA3,4,6,8,9,10的表达;茉莉酸处理导致DcCSLA11表达量显著上调,DcCSLA2,5,7,12,13显著下调,表明DcCSLA基因广泛参与生物和非生物胁迫的应答.这些结果为进一步研究铁皮石斛CSLA基因在葡苷聚糖合成积累方面的功能奠定了基础.