山茱萸萜类合成途径关键酶HMGR1基因的克隆与分析

• 作者: 侯典云 侯小改 徐静雅 李志红 杨萌萌 段佩玲 段姗姗
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 山茱萸 萜类 CoHMGR1 克隆 实时荧光定量PCR 序列分析
• 年，卷（期）: 2020,（18）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 4733-4738
• 页数: 6页
• 分类号: R286.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2020.18.017

摘要

目的 克隆山茱萸Cornus officinalis HMGR1的cDNA序列并进行生物信息学分析.方法 以山茱萸转录组数据中unigene c100572_g1序列为参考,在其开放阅读框两端设计特异引物,经实时荧光定量PCR(RT-PCR)扩增、连接pTOPO-T载体克隆并测序,获得CoHMGR1基因的cDNA序列,并利用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白进行相关分析.结果 CoHMGR1基因长2 116 bp,含长度为1 338 bp的完整开放阅读框(ORF),编码445个氨基酸,为疏水性蛋白.多序列比对和亲缘关系分析显示,CoHMGR1基因编码的氨基酸序列与喜树的序列相似性较高,达79.56％.结论 首次对山茱萸叶片和果实进行比较转录组测序的基础上,成功克隆并分析了CoHMGR1基因,为进一步研究CoHMGR1蛋白的功能及山茱萸萜类合成途径的分子机制奠定基础.