生物信息学分析缺血性脑卒中的差异表达基因

• 作者: 唐文静 唐标 彭伊孟 谭玉靓
• 来源期刊: 现代预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 缺血性脑卒中 生物信息学 差异表达基因 富集分析
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 所属期刊栏目: 实验技术及其应用
• 页码范围: 2228-2232
• 页数: 5页
• 分类号: R543
• 语种: 中文

摘要

目的 基于生物信息学,对缺血性脑卒中(IS)相关差异表达基因(DEGs)进行分子层面的分析,深入分析IS的发病机制和关键基因.方法 从GEO数据库下载与IS相关的生物基因芯片,基于P值及log |FC|值对GEO原始数据进行筛选,确定DEGs.对DEGs进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,了解DEGs介导的生物过程与代谢通路.利用String在线平台,构建DEGs的蛋白相互作用(PPI)网络.利用cytoscape的cytoHubba软件,找出IS的关键基因.结果 本研究共筛选出110个DEGs.功能和通路富集结果显示,上述基因参与MAPK、NF-kappa B、TNF等多种细胞因子和趋化因子的信号转导通路;共同介导炎症以及免疫应答、细胞凋亡等相关生物过程.PPI网络显示,这些基因之间具有相互作用关系.JUN、CXCL2和TNF为IS病理过程中的关键基因.结论 本研究结果揭示,IS的发生发展与炎症密切相关.针对关键基因进行靶向治疗,如JUN、CXCL2和TNF,或许对临床防治IS具有重要的发展意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐标	湖南中医药大学医学院	49	205	8.0	13.0
2	谭玉靓	湖南中医药大学医学院	2	0	0.0	0.0
3	唐文静	湖南中医药大学医学院	5	0	0.0	0.0
4	彭伊孟	湖南中医药大学医学院	1	0	0.0	0.0