基于网络药理学和分子对接分析达原饮治疗新型冠状病毒肺炎(COVID⁃19)的分子靶点和机制

• 作者: 张泽鑫 吴汶丰 谢丹 方舒涵 李红毅
• 来源期刊: 中药材
• 关键词: 网络药理学 分子对接 达原饮 新型冠状病毒肺炎 分子靶点 机制
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 新型冠状病毒肺炎专栏
• 页码范围: 2062-2069
• 页数: 8页
• 分类号: R285.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.13863/j.issn1001⁃4454.2020.08.050

摘要

目的:通过网络药理学分析和分子对接的方法,探究达原饮治疗新型冠状病毒肺炎(COVID?19)的分子靶点和机制,为中医药治疗COVID?19提供指导.方法:通过TCMSP和Drugbank数据库检索获取达原饮的有效中药成分和靶点.通过Genecards和OMIM数据库以"novel coronavirus pneumonia"为关键词搜索获取新型冠状病毒肺炎的靶点.通过生物信息学与进化基因组学系统得到两者的共有靶点.通过Cytoscape3.7.2构建达原饮治疗COVID?19分子靶点图.通过PPI蛋白互作网络结合Cytoscaape3.7.2的cytoHubb插件构建靶点相关关系图,寻找富集数目最多的靶点.通过R语言对达原饮治疗COVID?19的靶点进行GO和KEGG富集分析,采用AutoDock4.2和PyMol进行核心成分和靶点对接及可视化处理.结果:共得到达原饮有效中药成分166个,达原饮治疗新型冠状病毒肺炎主要中药成分83个,主要为来自草果、甘草的quercetin(槲皮素),来自知母、白芍的kaempferol(山柰酚);达原饮靶点203个;新型冠状病毒肺炎靶点253个;达原饮治疗COVID?19靶点45个,主要核心靶点为IL6、MAPK8、CASP3、IL10、IL1B;达原饮治疗COVID?19涉及GO 75条,主要为cytokine receptor binding;达原饮治疗CO?VID?19的KEGG通路148条,主要为AGE?RAGE signaling pathway in diabetic complications.分子对接结果显示达原饮治疗COVID?19的重要化合物槲皮素与核心靶点IL6、MAPK8、CASP3、IL10、IL1B有良好的亲和力.结论:通过网络药理学和分子对接分析,探析了达原饮治疗COVID?19的分子靶点和机制,为中医药治疗COVID?19提供参考.