4种模式植物LRR VIII-2亚家族基因的鉴定和进化历史分析

• 作者: 闫晨阳 陈赢男
• 来源期刊: 植物学报
• 关键词: 类受体蛋白激酶 富含亮氨酸重复 全基因组重复 串联重复
• 年，卷（期）: null,（null）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 442-456
• 页数: 14页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11983/CBB19157

摘要

全基因组重复与串联重复是发生基因重复的重要机制，也是基因组和遗传系统多样化的重要动力。LRR-RLK编码富含亮氨酸重复的类受体蛋白激酶，是被子植物进化史上发生大规模扩张而形成的多基因家族。拟南芥(Arabidopsis thaliana) AtLRR-RLK包含15个亚家族，AtLRR VIII-2是其中发生串联重复比例最高的亚家族。通过分析拟南芥、杨树(Populus trichocarpa)、萄(Vitis vinifera)和番木瓜(Carica papaya) 4种模式植物中LRR VIII-2亚家族基因的扩张及差异保留情况，结果显示，LRR VIII-2在杨树中的扩张程度最高，在拟南芥和葡萄中的扩张程度居中，但在番木瓜中发生丢失。拟南芥、杨树和葡萄LRR VIII-2亚家族具有旁系同源基因对，但在番木瓜中未发现旁系同源基因。除杨树中的1对旁系同源基因外，4种模式植物中LRR VIII-2亚家族的旁系和直系同源基因都受到较强的纯化选择作用。对LRR VIII-2亚家族进化历史的深入分析有助于理解基因重复在植物进化中的作用和意义，可为预测同源基因功能及解析其它基因家族进化历史提供参考。