竹类植物分蘖相关基因的生物信息学分析

• 作者: 孙佳玮 郭振华
• 来源期刊: 西南林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 竹类植物 地下茎 分蘖 基因
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 11-25
• 页数: 15页
• 分类号: S795
• 语种: 中文
• DOI: 10.11929/j.swfu.201910044

摘要

从水稻中选取相关的候选基因,对毛竹和4种新测序的竹类植物以及水稻、谷子和二穗短柄草的分蘖数相关基因和氨基酸序列进行比较,对粗型和细型2种地下茎类型的竹类植物中分蘖基因的同源序列进行分析.结果表明:D10、DLT、Gn1a、HTD1、LAX1、MOC1、OsAAP3、Os-CYP19-4、OsEATB、OsIAGLU、OsPIN1、OsPIN5b、OsSPL14、OsSUT2、OsTB1、RFL、THIS1等17个基因序列在不同地下茎类型的竹子中存在较明显的结构差异,在基因的进化树中,2种草本竹和禾草类植物关系较近,而与木本竹区分开,这或许为木本竹独特的地下茎系统提供一些分子依据;17个基因中调控分蘖增加或抑制分蘖生长的基因存在结构域的缺失,这种差异可能抑制毛竹(即细型地下茎竹类)的合轴生长,并使其进行地下茎延伸,从而形成真鞭,某些分蘖基因参与到各植物激素的信号通路中相互作用从而影响分蘖的产生.通过以上结果可推测,粗型地下茎与细型地下茎的形成可能与调控分蘖数目的基因,以及各类激素的作用相关.