miR-197结合HNRNPD的5'UTR区上调其蛋白表达

• 作者: 罗婧 杨丝雨 吴宇 王雨萌 郑煜芳
• 来源期刊: 复旦学报（自然科学版）
• 关键词: miR-197 异质核糖核蛋白D0 5’UTR
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 页码范围: 47-57,64
• 页数: 12页
• 分类号: Q522+.2
• 语种: 中文

摘要

microRNA介导的基因调节在发育和疾病调控中都发挥了重要的作用.我们实验室前期研究发现miR-197 可以调节神经干细胞分化.在本研究中,我们利用生物信息学数据库分析发现了9个miR-197的候选靶基因.qRT-PCR结果表明miR-197能下调其中8个基因的表达,但是显著上调了异质核糖核蛋白(Heterogeneous Nuclear RiboNucleoProtein,HNRNP)D0基因(HNRNPD)的表达.我们进一步实验发现,这种上调是通过miR-197与HNRNPD的5'UTR而不是3'UTR区的相互作用实现的.RNA pull-down实验证实miR-197的确与HNRNPD的5'UTR之间存在互补配对.并且敲低Ago2可以阻断miR-197介导的HNRNPD的上调,说明Ago2对于miR-197上调HNRNPD是必需的.已知HNRNPD能通过与AU-Rich Elements(AREs)结合来调控mRNA的降解.我们利用AutDB、SZDB和OMIM等多个数据库分析了几种神经发育障碍疾病(如自闭症和严重的智力障碍)的相关基因,发现这些基因含有比全基因组中更高比例的ARE-mRNA.因此,miR-197和HNRNPD在调节神经发育和相关疾病中可能具有重要作用.