基于生物信息学分析的TPX2在肺腺癌中的表达及意义

• 作者: 王庆亮 赵艳峰 蒋燕 宋晓 杨富钧 姜格宁
• 来源期刊: 同济大学学报（医学版）
• 关键词: TPX2 肺腺癌 生物信息学 预后
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究|Basic Research
• 页码范围: 11-18
• 页数: 8页
• 分类号: R734.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.12289/j.issn.1008-0392.20236

摘要

目的 利用多种肿瘤生物信息数据库分析TPX2在肺腺癌样本中的表达及临床意义,并在临床病理标本中进行验证.方法 通过检索Oncomine生物信息基因数据库,分析TPX2在不同肺腺癌数据集中mRNA表达情况;利用cBioportal生物信息基因数据库分析TPX2的突变频率、突变位点,并分析TPX2基因突变与预后的关系;利用HPA数据库的组织图谱分析TPX2蛋白质在肺腺癌组织中的表达情况.通过UALCAN和OncoLnc数据库检索肺腺癌与正常组织中TPX2的表达情况,分析其与肺腺癌临床病理分期的关系,并采用Kaplan-Meier在线分析TPX2表达与患者生存期的关系.通过Western印迹法实验对比肺癌患者癌组织与癌旁组织TPX2蛋白表达差异以及TPX2在不同肺癌细胞系中的表达情况.结果 Oncomine数据库的结果显示,TPX2在人肺腺癌不同数据集中的表达均显著高于正常肺组织(均P＜0.001),HPA数据库检索IHC实验结果显示:与正常肺组织相比,TPX2蛋白在癌组织中的表达水平显著上调(P＜0.05).生存分析发现高表达TPX2的肺腺癌患者的生存期显著低于TPX2低表达的肺腺癌患者,TPX2高表达患者预后更差(P＜0.05);cBioportal数据库分析结果显示,TPX2共有30个位点发生变异,总变异率为4％,其中有17个位点发生突变,突变频率分别为4.06％(TCGA PanCan),3.83％(Broad),且存在TPX2突变的肺腺癌患者的DFS更差(P＜0.05).在探讨TPX2在不同肺癌细胞系及肺腺癌组织和癌旁组织中的表达差异时,发现TPX2在肺鳞癌、肺腺癌、肺大细胞癌细胞系中均存在高表达,且TPX2在肺腺癌组织中的表达量显著高于癌旁组织(均P＜0.05).结论 基于肿瘤生物信息库综合分析发现,TPX2在肺腺癌组织中的表达水平明显高于正常肺组织,且TPX2的其表达水平与肿瘤预后具有相关性,TPX2在肺腺癌中的高表达预示患者预后不良.