基于TCGA数据库的肝细胞癌自噬相关基因预后风险模型的建立

• 作者: 许杨 尹侃 李霄霞 狄国虎 侯琳 赵春华
• 来源期刊: 青岛大学学报（医学版）
• 关键词: 癌 肝细胞 自噬 基因 预后 计算生物学
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 肿瘤学专题
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: R730.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.11712/jms.2096-5532.2021.57.021

摘要

目的 基于自噬相关基因(ATGs)构建肝细胞癌病人预后风险模型.方法 TCGA数据库下载374例肝细胞癌及50例正常肝组织的转录组数据和临床信息,首先筛选出差异表达基因(DEGs),然后从中筛选出差异表达的ATGs(DEATGs),最终利用单因素Cox回归分析、LASSO回归分析以及多因素Cox回归分析构建预后风险模型,并应用ROC曲线评估模型对于肝细胞癌病人预后的预测能力.结果 肝细胞癌组织与正常肝组织筛选得到12471个DEGs,其中包含62个DEATGs.单因素Cox回归分析得到40个预后相关DEATGs,LASSO回归分析以及多因素Cox回归分析得到7个风险自噬基因(RAB7A、FOS、ATG9A、HSPA8、PRKN、TUSC1和GAPDH)用于构建预后风险模型.Kaplan-Meier分析显示,高风险组病人的总体生存期显著低于低风险组(χ2=36.972,P<0.05).多因素Cox回归分析表明,预后风险模型可以作为一个独立预后因素(HR=2.574,P<0.01).结论 基于ATGs构建的预后风险模型是一个独立的预后因素,可有效预测肝细胞癌病人的预后.