基于网络药理学、分子对接和生物信息学对中药复方抑制COVID-19"细胞因子风暴"分子机制的探索与验证

• 作者: 杨莹莹 郭琼琼 唐芳芳 杨玉珍 李林 陈平
• 来源期刊: 中国医院药学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: COVID-19 中药复方 网络药理学 分子对接 细胞因子风暴
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 125-134
• 页数: 10页
• 分类号: R285
• 语种: 中文
• DOI: 10.13286/j.1001-5213.2021.02.02

摘要

目的:以确定临床疗效的6种推荐中药复方为研究对象,探索中药治疗COVID-19的分子机制和物质基础.方法:利用TCMSP、IMMPORT、OMIM等数据库获得治疗COVID-19的免疫靶点.Cytoscape3.4.0用于构建"免疫靶点-中药-化合物-疾病"网络以及网络拓扑学分析,随后进行PPI、G()功能和KEGG通路富集分析.AutoDock Vina用于分子对接.SsG-SEA利用转录组和microarray数据计算免疫细胞浸润程度.结果:对"免疫靶点-中药-化合物-疾病"网络进行拓扑学分析,本研究发现28种COVID-19免疫靶点高度关联化合物,对其进行分子对接发现豆甾醇、靛玉红、黄芩素等与血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2,angiotensin converting enzyme Ⅱ)以及新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶具有较好的结合活性.6种复方均通过TNF、IL-17等信号通路发挥抗炎、调节细胞因子活性.IL-6是6种复方抗COVID-19的共同核心免疫靶标.肺组织表达谱生物信息学分析证实IL-6的表达与活化CD8+T细胞、调节T细胞等免疫细胞的浸润高度有关,是免疫反应的关键分子.结论:中药复方的活性化合物豆甾醇、靛玉红、黄芩素等作用于IL-6、IL-10、IL-1B等免疫靶点调节TNF、IL-17等多条信号通路,从而发挥抑制COVID-19"细胞因子风暴"的作用.