牙龈卟啉单胞菌外膜囊泡差异表达mRNA的生物信息学分析

• 作者: 阮毅 艾俊 江春 招洛丹 夏昕 刘墨
• 来源期刊: 中华口腔医学研究杂志（电子版）
• 关键词: 牙龈卟啉单胞菌 外膜囊泡 高通量筛选 双组分信号转导系统
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 基础研究|Basic Science Research
• 页码范围: 135-141
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3877/cma.j.issn.1674-1366.2021.03.002

摘要

目的 探讨牙龈卟啉单胞菌(P.gingivalis)W83与ATCC33277外膜囊泡mRNA表达谱的差异.方法 超速离心法分离W83和ATCC33277来源的外膜囊泡,进行粒径检测、电镜及Western blot鉴定;高通量测序检测W83和ATCC33277外膜囊泡mRNA表达谱,筛选差异表达的mRNA,进行基因本体论(GO)注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.结果 牙龈卟啉单胞菌W83和ATCC33277分离的外膜囊泡符合囊泡特征;W83外膜囊泡中鉴定出1629个mRNA,ATCC33277外膜囊泡中鉴定出1505个mRNA,差异表达的mRNA共594个.差异具有统计学意义的mRNA参与的途径包括生物膜形成-霍乱弧菌(P=0.011)、核糖体(P=0.015)和细菌双组分调节系统(P=0.026).结论 牙龈卟啉单胞菌W83与ATCC33277外膜囊泡mRNA表达存在差异.