甘蔗新基因ShUGT2的生物信息学分析及亚细胞定位

• 作者: 李延博 王俊刚 赵婷婷 张树珍 熊国如
• 来源期刊: 热带农业科学
• 关键词: 甘蔗 UDP-糖基转移酶 基因克隆 生物信息学分析 亚细胞定位
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术与生理生化|Biotechnology and Physiology and Biochemistry
• 页码范围: 25-32
• 页数: 8页
• 分类号: S435.661
• 语种: 中文
• DOI: 10.12008/j.issn.1009-2196.2021.05.005

摘要

UDP-糖基转移酶在植物体内负责糖基化修饰,对植物的生长发育起着关键作用.以甘蔗品种ROC22为供试材料,提取成熟叶片总RNA并反转录合成cDNA,经PCR扩增获得ShUGT2基因cDNA全长序列,对其进行生物信息学、亚细胞定位和组织特异性表达分析.结果表明:ShUGT2含有1782 bp的完整开放阅读框,编码593个氨基酸,其编码蛋白与高粱UDP-糖基转移酶同源性达到92.45％.ShUGT2编码蛋白不稳定系数为48.68,疏水性指数-0.338,是一种亲水性蛋白;在20～42个氨基酸的位置,有一个跨膜区;在309～514个氨基酸,存在UDP-糖基转移酶的家族特异保守结构域,属于GT8家族成员,其功能是通过合成木聚糖,调控细胞内半纤维素成分,维持植物的生长发育.亚细胞定位分析表明,ShUGT2编码蛋白定位于线粒体;在甘蔗的根、茎、叶组织中,ShUGT2基因均有表达,与甘蔗的生长发育密切相关.本研究结果为进一步分析ShUGT2基因功能提供了科学依据.